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Research Article

Application of a New Method for GWAS in a Related Case/Control Sample with Known Pedigree Structure: Identification of New Loci for Nephrolithiasis

  • Silvia Tore,

    Affiliation: Istituto di Genetica delle Popolazioni – CNR, Sassari, Italy

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  • Stefania Casula,

    Affiliation: Istituto di Genetica delle Popolazioni – CNR, Sassari, Italy

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  • Giuseppina Casu,

    Affiliation: Istituto di Genetica delle Popolazioni – CNR, Sassari, Italy

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  • Maria Pina Concas,

    Affiliation: Istituto di Genetica delle Popolazioni – CNR, Sassari, Italy

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  • Paola Pistidda,

    Affiliation: Istituto di Genetica delle Popolazioni – CNR, Sassari, Italy

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  • Ivana Persico,

    Affiliation: Istituto di Genetica delle Popolazioni – CNR, Sassari, Italy

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  • Alessandro Sassu,

    Affiliation: Shardna Life Sciences, Pula, Cagliari, Italy

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  • Giovanni Battista Maestrale,

    Affiliation: Istituto di Genetica delle Popolazioni – CNR, Sassari, Italy

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  • Caterina Mele,

    Affiliation: Istituto di Ricerche Farmacologiche Mario Negri, Centro di Ricerche Cliniche per le Malattie Rare “Aldo e Cele Daccò”, Ranica, Bergamo, Italy

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  • Maria Rosa Caruso,

    Affiliation: Unità Operativa Nefrologia e Dialisi Ospedali Riuniti di Bergamo, Bergamo, Italy

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  • Bibiana Bonerba,

    Affiliation: Unità di Nefrologia Dialisi e Trapianto, Dipartimento dell'Emergenza e dei Trapianti d'Organo (DETO), Università degli Studi, Bari, Italy

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  • Paolo Usai,

    Affiliation: Clinica Urologica, Ospedale “Santissima Trinità”, Cagliari, Italy

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  • Ivo Deiana,

    Affiliation: Dipartimento di Urologia, Ospedale Nostra Signora della Mercede, Lanusei, Italy

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  • Timothy Thornton,

    Affiliation: Department of Biostatistics, University of Washington, Seattle, Washington, United States of America

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  • Mario Pirastu,

    Affiliations: Istituto di Genetica delle Popolazioni – CNR, Sassari, Italy, Shardna Life Sciences, Pula, Cagliari, Italy

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  • Paola Forabosco mail

    paola.forabosco@cnr.it

    Affiliation: Istituto di Genetica delle Popolazioni – CNR, Sassari, Italy

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  • Published: January 20, 2011
  • DOI: 10.1371/journal.pgen.1001281

About the Authors

Silvia Tore, Stefania Casula, Giuseppina Casu, Maria Pina Concas, Paola Pistidda, Ivana Persico, Giovanni Battista Maestrale, Mario Pirastu, Paola Forabosco
Istituto di Genetica delle Popolazioni – CNR, Sassari, Italy
Alessandro Sassu, Mario Pirastu
Shardna Life Sciences, Pula, Cagliari, Italy
Caterina Mele
Istituto di Ricerche Farmacologiche Mario Negri, Centro di Ricerche Cliniche per le Malattie Rare “Aldo e Cele Daccò”, Ranica, Bergamo, Italy
Maria Rosa Caruso
Unità Operativa Nefrologia e Dialisi Ospedali Riuniti di Bergamo, Bergamo, Italy
Bibiana Bonerba
Unità di Nefrologia Dialisi e Trapianto, Dipartimento dell'Emergenza e dei Trapianti d'Organo (DETO), Università degli Studi, Bari, Italy
Paolo Usai
Clinica Urologica, Ospedale “Santissima Trinità”, Cagliari, Italy
Ivo Deiana
Dipartimento di Urologia, Ospedale Nostra Signora della Mercede, Lanusei, Italy
Timothy Thornton
Department of Biostatistics, University of Washington, Seattle, Washington, United States of America

Corresponding Author

Email: paola.forabosco@cnr.it

Competing Interests

The authors have declared that no competing interests exist.

Author Contributions

Performed the experiments: SC GC IP AS GBM. Analyzed the data: TT PF. Contributed reagents/materials/analysis tools: CM MRC BB PU ID. Wrote the paper: ST TT PF. Designed the study: PF ST MP. Contributed to statistical analyses: MPC. Contributed to paper writing: PP.