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Research Article

Alliance of Proteomics and Genomics to Unravel the Specificities of Sahara Bacterium Deinococcus deserti

  • Arjan de Groot mail,

    nicolaas.degroot@cea.fr

    Affiliations: CEA, DSV, IBEB, Laboratory of Microbial Ecology of the Rhizosphere and Extreme Environments (LEMiRE), Saint-Paul-lez-Durance, France, CNRS, UMR 6191, Biologie Vegetale et Microbiologie Environnementales, Saint-Paul-lez-Durance, France, Aix-Marseille Université, Saint-Paul-lez-Durance, France

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  • Rémi Dulermo,

    Affiliations: CEA, DSV, IBEB, Laboratory of Microbial Ecology of the Rhizosphere and Extreme Environments (LEMiRE), Saint-Paul-lez-Durance, France, CNRS, UMR 6191, Biologie Vegetale et Microbiologie Environnementales, Saint-Paul-lez-Durance, France, Aix-Marseille Université, Saint-Paul-lez-Durance, France

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  • Philippe Ortet,

    Affiliations: CEA, DSV, IBEB, Laboratory of Microbial Ecology of the Rhizosphere and Extreme Environments (LEMiRE), Saint-Paul-lez-Durance, France, CNRS, UMR 6191, Biologie Vegetale et Microbiologie Environnementales, Saint-Paul-lez-Durance, France, Aix-Marseille Université, Saint-Paul-lez-Durance, France

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  • Laurence Blanchard,

    Affiliations: CEA, DSV, IBEB, Laboratory of Microbial Ecology of the Rhizosphere and Extreme Environments (LEMiRE), Saint-Paul-lez-Durance, France, CNRS, UMR 6191, Biologie Vegetale et Microbiologie Environnementales, Saint-Paul-lez-Durance, France, Aix-Marseille Université, Saint-Paul-lez-Durance, France

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  • Philippe Guérin,

    Affiliation: CEA, DSV, IBEB, Lab Biochim System Perturb, Bagnols-sur-Cèze, France

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  • Bernard Fernandez,

    Affiliation: CEA, DSV, IBEB, Lab Biochim System Perturb, Bagnols-sur-Cèze, France

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  • Benoit Vacherie,

    Affiliation: CEA, Institut de Génomique, Génoscope, Evry Cedex, France

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  • Carole Dossat,

    Affiliation: CEA, Institut de Génomique, Génoscope, Evry Cedex, France

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  • Edmond Jolivet,

    Affiliation: Université Paris-Sud 11, CNRS UMR 8621, CEA LRC42V, Institut de Génétique et Microbiologie, Université Paris Sud, Orsay Cedex, France

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  • Patricia Siguier,

    Affiliation: Laboratoire de Microbiologie et Génétique Moléculaire, CNRS UMR5100, Toulouse Cedex, France

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  • Michael Chandler,

    Affiliation: Laboratoire de Microbiologie et Génétique Moléculaire, CNRS UMR5100, Toulouse Cedex, France

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  • Mohamed Barakat,

    Affiliations: CEA, DSV, IBEB, Laboratory of Microbial Ecology of the Rhizosphere and Extreme Environments (LEMiRE), Saint-Paul-lez-Durance, France, CNRS, UMR 6191, Biologie Vegetale et Microbiologie Environnementales, Saint-Paul-lez-Durance, France, Aix-Marseille Université, Saint-Paul-lez-Durance, France

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  • Alain Dedieu,

    Affiliation: CEA, DSV, IBEB, Lab Biochim System Perturb, Bagnols-sur-Cèze, France

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  • Valérie Barbe,

    Affiliation: CEA, Institut de Génomique, Génoscope, Evry Cedex, France

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  • Thierry Heulin,

    Affiliations: CEA, DSV, IBEB, Laboratory of Microbial Ecology of the Rhizosphere and Extreme Environments (LEMiRE), Saint-Paul-lez-Durance, France, CNRS, UMR 6191, Biologie Vegetale et Microbiologie Environnementales, Saint-Paul-lez-Durance, France, Aix-Marseille Université, Saint-Paul-lez-Durance, France

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  • Suzanne Sommer,

    Affiliation: Université Paris-Sud 11, CNRS UMR 8621, CEA LRC42V, Institut de Génétique et Microbiologie, Université Paris Sud, Orsay Cedex, France

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  • Wafa Achouak,

    Affiliations: CEA, DSV, IBEB, Laboratory of Microbial Ecology of the Rhizosphere and Extreme Environments (LEMiRE), Saint-Paul-lez-Durance, France, CNRS, UMR 6191, Biologie Vegetale et Microbiologie Environnementales, Saint-Paul-lez-Durance, France, Aix-Marseille Université, Saint-Paul-lez-Durance, France

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  • Jean Armengaud

    Affiliation: CEA, DSV, IBEB, Lab Biochim System Perturb, Bagnols-sur-Cèze, France

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  • Published: March 27, 2009
  • DOI: 10.1371/journal.pgen.1000434

About the Authors

Arjan de Groot, Rémi Dulermo, Philippe Ortet, Laurence Blanchard, Mohamed Barakat, Thierry Heulin, Wafa Achouak
CEA, DSV, IBEB, Laboratory of Microbial Ecology of the Rhizosphere and Extreme Environments (LEMiRE), Saint-Paul-lez-Durance, France
Arjan de Groot, Rémi Dulermo, Philippe Ortet, Laurence Blanchard, Mohamed Barakat, Thierry Heulin, Wafa Achouak
CNRS, UMR 6191, Biologie Vegetale et Microbiologie Environnementales, Saint-Paul-lez-Durance, France
Arjan de Groot, Rémi Dulermo, Philippe Ortet, Laurence Blanchard, Mohamed Barakat, Thierry Heulin, Wafa Achouak
Aix-Marseille Université, Saint-Paul-lez-Durance, France
Philippe Guérin, Bernard Fernandez, Alain Dedieu, Jean Armengaud
CEA, DSV, IBEB, Lab Biochim System Perturb, Bagnols-sur-Cèze, France
Benoit Vacherie, Carole Dossat, Valérie Barbe
CEA, Institut de Génomique, Génoscope, Evry Cedex, France
Edmond Jolivet, Suzanne Sommer
Université Paris-Sud 11, CNRS UMR 8621, CEA LRC42V, Institut de Génétique et Microbiologie, Université Paris Sud, Orsay Cedex, France
Patricia Siguier, Michael Chandler
Laboratoire de Microbiologie et Génétique Moléculaire, CNRS UMR5100, Toulouse Cedex, France

Corresponding Author

Email: nicolaas.degroot@cea.fr

Competing Interests

The authors have declared that no competing interests exist.

Author Contributions

Conceived and designed the experiments: AdG TH SS JA. Performed the experiments: AdG RD PO LB PG BF BV CD EJ AD VB JA. Analyzed the data: AdG RD PO LB PG PS MC MB AD SS WA JA. Contributed reagents/materials/analysis tools: PO MB. Wrote the paper: AdG JA. Contributed to writing the paper: SS.